多杀性巴氏杆菌（Pasteurella multocida, PM）是一种在全球范围内导致重要经济损失的机会性致病菌，可引起人类和多种动物的感染。机会性致病菌动态性的基因组主要通过移动元件和噬菌体衍生的基因岛(Genomic Island, GIs)帮助细菌快速获取外源基因片段。然而对于多杀性巴氏杆菌的基因岛及基因岛对其群体遗传学的研究相对缺乏。
生物信息学分析软件比对114株多杀性巴氏杆菌全基因组，并确定多杀性巴氏杆菌的泛基因组含3948个编码基因并呈开放性进化模式，其系统发育关系与宿主来源、地理位置密切相关。而所有菌株中共存在280个基因岛，基因岛中存在的相关基因占泛基因组中核心基因5.8%，与其代谢活动密切相关；附属基因42.3%，主要为适应性基因的富集；特有基因35.4%，含有与防御机制相关的基因。通过GI为菌株带来的特殊基因比例及功能，GI对菌株进化和环境适应的特殊性在一定程度上得以体现。
这项研究结果丰富了基因岛在多杀性巴氏杆菌细菌群体进化过程中对群体基因组的影响，同时整合的GI数据也有助于进一步对其相关遗传进化机制的研究。相关结果以“Comparative analysis reveals the Genomic Islands in Pasteurella multocida population genetics: on Symbiosis and adaptability”为题发表于BMC Genomics 2019,20:63; doi.org/10.1186/s12864-018-5366-6。
