四川农业大学动物医学免疫学研究所程安春教授团队近日在基因组学领域的TOP期刊《BMC Genomics》上发表了一篇题为《Genome-wide association study reveals serovar-associated genetic loci in Riemerella anatipestifer》的研究论文，揭示了与鸭疫里默氏菌（Riemerella anatipestifer，RA）的血清型相关遗传基础。
RA是一种重要的兽医病原菌，主要感染家禽，引起急性或慢性败血症。给全球鸭业造成巨大的经济损失。根据血清凝集反应，RA被分为至少21个血清型，但其血清学遗传基础尚不清楚。研究利用全基因组关联分析（Pan-GWAS）的方法，从全基因组水平上鉴定了与RA血清型相关的基因位点。研究结果显示，RA的荚膜多糖（CPS）合成基因簇与血清学表型有显著的关联。进一步对11个血清型代表菌株的CPS基因簇的特征分析表明，它们具有高度的多样性和血清型特异性。RA CPS的合成依赖于Wzx/Wzy途径。类似的CPS位点也在威克斯氏菌科的其他物种中发现。研究还证明了在RA中删除wzy基因会导致CPS的缺陷和交叉凝集的现象。本研究表明，RA的CPS合成基因簇是一个血清型特异性的基因位点。更重要的是，本研究为系统分析RA血清型的遗传基础和建立完整的分子血清学方案提供了新的视角。
图1. 鸭疫里默氏菌CPS基因簇系统发育与核心基因组系统发育的比较
该论文第一署名单位为四川农业大学，程安春教授为唯一通讯作者。该论文受到了国家农业产业技术体系 (CARS-42–17)和四川省兽药创新团队 (SCCXTD-2023–18) 项目的资助。文章链接：https://doi.org/10.1186/s12864-024-09988-4
