鸭传染性浆膜炎是一种由鸭疫里默氏杆菌（RA）引起的高致病性水禽传染病。随着基因组学技术的快速发展，已经完成了超过27株RA的全基因组序列。在物种进化过程中，由于地理因素、环境因素等的影响，每个个体都形成了不同的表型，单一个体的基因组已经不能涵盖这个物种的所有遗传信息。本研究首次采用泛基因组学的方法对RA基因组进行大规模的比较分析，研究了RA群体的基因组成及基因组分特征。RA泛基因组由核心基因组、附属基因组和独有基因3部分组成，分析结果发现RA属于开放型泛基因组。通过多序列位点分型分析，我们推测广东省可能是我国RA流行的发源地。水平基因转移是是物种进化和基因组革新的重要驱动力之一，我们在555个独有基因中预测出387个水平转移基因。通过对这些基因的功能分析结果表明，它们主要与细菌毒力相关。最后通过结合泛基因组学和反向疫苗学的方法，我们从1113个RA核心基因中预测出195个疫苗候选靶点和56个药物靶点，为今后候选疫苗和药物的开发奠定基础。
相关研究内容以“Comparative genome-scale modelling of the pathogenic Flavobacteriaceae species Riemerella anatipestifer in China”为题发表于国际知名微生物学杂志Environmental microbiology， doi: 10.1111/1462-2920.14635。
