新方法揭示戊型肝炎病毒介导的tRNA组重构
作者:    发布于:2020-03-26 00:35:34    点击数:

     

        宿主tRNA与病毒密码子的相互作用在翻译水平参与调节病毒的适应性。病毒可以通过适应宿主密码子的使用模式或调节宿主tRNA组水平,以此增强病毒基因表达。戊型肝炎是重要的人兽共患传染病,其病原为戊型肝炎病毒(HEV)。我们发现,戊型肝炎病毒(HEV)与人类密码子的使用模式关联较弱。这促使我们转向探索HEV感染对宿主tRNAome的影响。但tRNAome定量在很大程度上受到tRNA基本特性的限制,其序列短和tRNA基因在染色体冗余编码。为此,我们开发了一种通用的简化qPCR方法,涉及一种新的DNA/RNA杂交接头和多对简并引物。使用这种新方法,我们发现HEV感染可以重构肝细胞tRNA组的水平,促进病毒RNA的翻译。这种简易的tRNAome定量方法对tRNA研究,以及基于tRNA的诊断具有广泛应用价值。
       相关研究结果以“A simplified qPCR method revealing tRNAome remodeling upon infection by genotype 3 hepatitis E virus”为题发表在杂志FEBS letter(DOI: 10.1002/1873-3468.13764.)。
       文章链接:https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/1873-3468.13764.

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