沙门菌是一种分布广泛的食源性病原菌，具有 2600 多种血清型和令人担忧的抗菌素耐药性 （AMR）。水禽是沙门菌传播的一个重要来源，但有关于沙门菌在水禽中的流行情况和耐药性研究仍然较少。本研究从水禽样本中共获得 126 株沙门菌分离株 （2018-2020 年 65 株， 2002-2005 年61 株）。我们系统检测了这些分离株的血清型、脉冲场凝胶电泳 （PFGE） 分型，以及AMR 表型和基因型。所有的分离株分布在 6 个血清群， PFGE 特征也显示出多样性，且均具有多重耐药性，对 49 株分离株进行全基因组测序，发现沙门菌携带的 AMR 基因种类繁多，包括多个外排泵基因和特异性耐药基因。有趣的是， tet (A)/tet (B) 和 catII 抗性基因仅在早年分离株中检测到，而gyrA (S83F、D87N 和 D87G) 和gyrB (E466D) 突变在近年分离株中更为常见，这与不同时期的分离株具有不同的耐药模式是一致的。此外，我们还检测到8种质粒复制子，表明多种耐药质粒在沙门菌中传播，这可能有助于 AMR 基因的水平转移并为沙门菌带来竞争优势。相关研究以 “Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance profiles in Salmonella isolated from waterfowl in 2002–2005 and 2018–2020 in Sichuan, China” 为题在线发表于 Frontiers in Microbiology 杂志（IF=6.064），https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.987613。
