鸭瘟病毒（DPV）属于疱疹病毒，是一种线性双链DNA病毒。鸭瘟（DP）是对我国水禽产业危害最严重的疫病之一，常常造成巨大的经济损失。已有研究表明长非编码RNA（lncRNA）在调节宿主抗病毒免疫应答方面具有巨大潜力。本研究通过高通量RNA测序（RNA-seq）鉴定了DPV感染的鸭胚胎成纤维细胞（DEF）中的lncRNA和mRNA。分析结果显示，在感染后30 hpi我们获得了218个差异表达的lncRNA和2840个差异表达mRNA。并且在生信分析中形成了可能的靶向互作网络。在可能关系对中，一些已被鉴定为免疫相关分子，如巨噬细胞甘露糖受体（MR）、Anas platyrhynchos toll样受体2（TLR2）、白细胞分化抗原、白细胞介素家族及其相关调节因子。此外，根据KEGG和GO富集分析，结果发现目标基因可能对生物发育、生物合成、信号转导、细胞生物学调节和细胞过程具有重要影响。此外，还通过软件获得了宿主lncRNA和DPV编码的miRNA之间的潜在靶向关系。
成果以“Differential expression profile and in-silico functional analysis of long noncoding RNA and mRNA in duck embryo fibroblasts infected with duck plague virus”在期刊《BMC Genomics》（IF=4.547）上发表。doi: 10.1186/s12864-022-08739-7.
图1. DPV感染的DEFs中lncRNA/mRNA表达的差异分析
